1946年9月，国民党开始全面进攻。绥远省傅作义的部队攻占了绥东解放区的集宁、丰镇等地，后又攻占了张家口。10月，热河的国民党军队攻占了承德、赤峰。中央局指示内蒙古自治运动联合会及内蒙古党委向冀热辽分局靠拢，就近接受分局领导。内蒙古党委到达林西后，与冀热辽分局共同研究了成立内蒙古自治政府的有关问题。11月26日，中央指示：为了团结内蒙古人民，共同抵抗蒋介石的军事进攻与政治经济压迫，联合成立地方性的高度自治政府。

　　东北局电邀内蒙古自治运动联合会各负责人前去，准备召开联合会执行会议并且成立内蒙古自治政府。1947年2月14日，乌兰夫率领联合会领导机关来到兴安盟王爷庙。3月23日，中央又向各有关中央局、分局发出《关于内蒙古诸问题的意见》的电报，指出“内蒙古自治政府非独立政府，它所反对的为蒋介石国民党独裁政府及其制定的取消民族自治权利的伪宪法与真卖国内战的反动政策”，电报还提出一些起草自治政府纲领和组织法必须注意的问题。有了中央明确而具体的指示，哈尔滨会议讨论起草了自治政府《施政纲领》和《暂行组织大纲》，拟订了自治政府的领导人选，乌兰夫为内蒙古自治政府主席，博彦满都担任参议会议长，哈丰阿担任自治政府副主席。会议结果报东北局并且转呈中央批准。1947年4月3日，内蒙古自治运动联合会执委扩大会议召开。会议讨论通过了《内蒙古自治政府施政纲领》和《内蒙古自治政府暂行组织大纲》。

　　1947年4月23日，内蒙古人民代表大会在兴安盟王爷庙的成吉思汗庙山脚下隆重开幕，392名代表庄重步入会场。大会选举了以乌兰夫为首的大会主席团和以哈丰阿为首的大会提案审查委员会，并且对执委扩大会议向大会提交的《内蒙古自治政府暂行组织大纲》以及《大会选举条例》等展开热烈讨论，获得一致通过。会议通过的《内蒙古自治政府施政纲领》明确了自治政府的性质和新民族关系，体现了中国共产党的民族政策和民族区域自治主张。29日，大会全体代表进行无记名投票，由121人组成的内蒙古自治政府第一届临时参议会顺利产生。全体参议员随后进行民主选举，乌兰夫当选为政府主席，哈丰阿当选为政府副主席，博彦满都当选为参议会议长，吉雅泰当选为参议会副议长，大会还选出政府委员19名，参议会驻会议员9名。

　　1947年5月1日19时，内蒙古自治政府宣告成立。2日，内蒙古自治政府第一届委员会举行会议。会议讨论通过了《内蒙古人民代表大会决议》，确定5月1日为内蒙古自治政府成立纪念日，内蒙古自治运动联合会会旗为内蒙古自治政府旗，内蒙古自治政府所在地暂定为兴安盟王爷庙街。3日，内蒙古自治政府隆重举行成立典礼。以乌兰夫主席为代表的政府组成人员和第一届临时参议会驻会议员正式宣誓就职：“余等誓以至诚，为内蒙古人民服务，并为坚决争取自卫战争与解放战争之胜利，与彻底解放内蒙古而奋斗！”坚定有力的誓词道出了各族人民的心声，赢得了经久不息的掌声。当日下午举行了阅兵仪式。5月19日，毛主席、朱总司令给内蒙古人民代表会议发来贺电，祝贺内蒙古人民创造了自由光明的新历史。

　　内蒙古自治区是中华大地上诞生的第一个省级民族区域自治地方，这证明了党制定的区域自治政策是完全正确的，并且为我国其他少数民族的解放树立了光辉典范。